Publications
Papers
2024
Liyanage, N.S, Awwad, F., dos Santos, K.C.G., Jayawardena, T.U., Merindol, N. & Desgagné-Penix, I. Navigating Amaryllidaceae Alkaloids: Bridging Gaps and Charting Biosynthetic Territories – A Comprehensive Review. Journal of Experimental Botany, erae187. DOI: 10.1093/jxb/erae187
Bucknell, A., Wilson, H., dos Santos, K.C.G., Simpfendorfer, S., Milgate, A., Germain, H., Solomon, P., Bentham, A. & McDonald, M. Sanctuary: A Starship transposon facilitating the movement of the virulence factor ToxA in fungal wheat pathogens. bioRxiv. DOI: 10.1101/2024.03.04.583430
2023
Koirala, M., dos Santos, K.C.G., Gélinas, S.-E., Ricard, S., Karimzadegan, V., Lamichhane, B., Liyanage, N.S., Merindol, N. & Desgagné-Penix, I. Auxin and light-mediated regulation of growth, morphogenesis, and alkaloid biosynthesis in Crinum x powellii 'Album' callus. Phytochemistry, 216: 113883. DOI: 10.1016/j.phytochem.2023.113883
2021
Rahman, M.S, Madina, M.H.,Plourde, M.B., dos Santos, K.C.G., Huang, X., Zhang, Y, Laliberté, J.-F., Germain, H. The fungal effector Mlp37347 alters plasmodesmata fluxes and enhances susceptibility to pathogen. Microorganisms (2021), 9(6): 1232. DOI: 10.3390/microorganisms9061232
dos Santos, K.C.G., Pelletier, G., Séguin, A. Guillemette, F., Hawkes, J., Desgagné-Penix, I. & Germain, H. Unrelated fungal rust candidate effectors act on overlapping plant functions. Microorganisms (2021), 9(5): 996. DOI: 10.3390/microorganisms9050996.
2020
dos Santos, K.C.G., Desgagné-Penix, I. & Germain, H. Custom selected reference genes outperform pre-defined reference genes in transcriptomic analysis. BMC Genomics (2020), 21(35). DOI: 10.1186/s12864-019-6426-2
2019
Fradj, N., dos Santos, K.C.G., Montigny, N., Awwad, F., Boumghar, Y., Germain, H., Desgagné-Penix, I. RNA-Seq de novo assembly and differential transcriptome analysis of Chaga (Inonotus obliquus) cultured with different betulin sources and the regulation of genes involved in terpenoid biosynthesis. International Journal of Molecular Sciences (2019), 20(18): 4334. DOI: 10.3390/ijms20184334
Lorrain, C., Gonçalves dos Santos, K.C., Germain, H., Hecker, A. and Duplessis, S. Advances in understanding obligate biotrophy in rust fungi. New Phytologist (2019), 222: 1190-1206. DOI: 10.1111/nph.15641
2018
dos Santos, K.C.G., McDonald, M. High molecular weight DNA extraction for long read sequencing v1. Protocols.io (2018), DOI: 10.17504/protocols.io.uppevmn
Ahmed, M.B., Santos, K.C.G.d., Sanchez, I.B., Petre, B., Lorrain, C., Plourde, M.B., Duplessis, S., Desgagné-Penix, I, Germain, H. A rust fungal effector binds plant DNA and modulates transcription. Scientific Reports (2018), 8, 14718, DOI: 10.1038/s41598-018-32825-0
2013
dos Santos, K.C.G.; Lopez, D.S.H. ; Perez, L.M.; Roberti, L.; Schmid, P.; Figueiredo, I.; Peres, C.K.; C.A. Rojas. Gluconacetobacter diazotrophicus enhances growth initial stages of Ilex paraguariensis development. II Conferência Iberoamericana de Interaçoes Benéficas Microorganismos-Planta-Ambiente (IBEMPA) (2013), p.450-451 (Extended abstract).
Oral presentations
2020
dos Santos, K.C.G., Desgagné-Penix, I. & Germain, H. 2017. Impact of fungal virulence proteins on in plants. Conferences Webs du Centre SÉVE (online).
2017
dos Santos, K.C.G., Desgagné-Penix, I. & Germain, H. 2017. Transcriptomic and metabolomic analysis of the alteration of physiological processes in a collection of transgenic plants expressing fungal effectors. Journées du Centre SÉVE, Orford, Canada
2014
dos Santos, K.C.G.; Lopez, D.S.H. ; Perez, L.M.; Roberti, L.; Schmid, P.; Figueiredo, I.; Peres, C.K.; Rojas, C.A. 2014. Análise da interação endofítica de microorganismos benéficos e a erva-mate. III Encontro de Iniciação Científica da Unila “Pesquisa no século XXI: desafios e possibilidades”. In: Anais do III Encontro de Iniciação Científica da Unila “Pesquisa no século XXI: desafios e possibilidades”, p.135, Foz do Iguaçu, Brazil.
2013
dos Santos, K.C.G.; Lopez, D.S.H. ; Perez, L.M.; Roberti, L.; Schmid, P.; Figueiredo, I.; Peres, C.K.; Rojas, C.A. 2013. Evaluación de la respuesta de la yerba mate a la inoculación con microorganismos potencialmente benéficos. II Congreso Paraguayo de Recursos Naturales y Medio Ambiente, Asunción, Paraguay.
dos Santos, K.C.G.; Lopez, D.S.H. ; Perez, L.M.; Roberti, L.; Schmid, P.; Figueiredo, I.; Peres, C.K.; Rojas, C.A. 2013. Avaliação da Resposta da Erva-mate à Inoculação com Microorganismos Potencialmetne Benéficos. II Encontro de Iniciação Científica da Unila “Resultados em debate”. In: Anais do 2º Encontro de Iniciação Científica da Unila “Resultados em debate”, p.55-56, Foz do Iguaçu, Brazil.
Poster presentations
2022
dos Santos, K.C.G., Porth, I., Villareal, J.C. & Khasa, D. 2022. Génomique des populations végétales dans les zones minières boréales canadiennes. Colloque du CEN Edition 2022. Québec, Canada. (online)
2021
dos Santos, K.C.G., Porth, I., Villareal, J.C. & Khasa, D. 2021. Plant population genomics in Canadian boreal mining areas. Concours d’affiches scientifiques étudiantes 2021 du Centre SÈVE. Canada. (online)
2020
dos Santos, K.C.G., Pelletier, G., Séguin, A. Guillemette, F., Hawkes, J., Desgagné-Penix, I. & Germain, H. Differential alteration of plant functions by homologous fungal candidate effectors. Concours d’affiches scientifiques étudiantes 2020 du Centre SÈVE (online).
dos Santos, K.C.G., Desgagné-Penix, I. & Germain, H. 2020. Étude des plantes exprimant des protéines de virulence de la rouille du peuplier. Contest of scientific Posters - UQTR, Trois-Rivières, Canada.
2019
dos Santos, K.C.G., Desgagné-Penix, I. & Germain, H. 2019. Transcriptomics and metabolomics of Arabidopsis expressing effectors from the poplar rust. Réunion conjointe Centre SÉVE-SPPQ, Bromont, Canada.
dos Santos, K.C.G., Desgagné-Penix, I. & Germain, H. 2019. Effectors from poplar rust modulate Arabidopsis transcriptome. IS-MPMI 2019, Glasgow, United Kingdom.
dos Santos, K.C.G., Desgagné-Penix, I. & Germain, H. 2019. Custom selected reference genes outperform pre-defined reference genes in transcriptomic analysis. Plant Canada 2019, Guelph, Canada.
dos Santos, K.C.G., Desgagné-Penix, I. & Germain, H. 2019. Facteurs de virulence fongique modulent le transcriptome d’Arabidopsis. Contest of scientific Posters - UQTR, Trois-Rivières, Canada.
2018
dos Santos, K.C.G., Desgagné-Penix, I. & Germain, H. 2018. Analysis of transcriptomic alterations in a collection of transgenic plants expressing fungal effectors. Plant Biology 2018, Montreal, Canada.
dos Santos, K.C.G., Desgagné-Penix, I. & Germain, H. 2018. Analysis of transcriptomic alterations in a collection of transgenic plants expressing fungal effectors. Contest of scientific Posters - UQTR, Trois-Rivières, Canada.
2017
dos Santos, K.C.G., Desgagné-Penix, I. & Germain, H. 2017. Transcriptomic and metabolomic analysis of the alteration of physiological processes in a collection of transgenic plants expressing fungal effectors. Contest of scientific posters - UQTR, Trois-Rivières, Canada.
2014
dos Santos, K.C.G.; Lopez, D.S.H. ; Perez, L.M.; Roberti, L.; Schmid, P.; Figueiredo, I.; Peres, C.K.; Rojas, C.A. 2014. Promoción del crecimiento de Ilex paraguariensis mediada por Gluconacetobacter diazotrophicus y su relación con el metabolismo del nitrógeno. In: Memorias del VI Congreso Sudamericano de Yerba Mate y II Simposio Internacional de Yerba-Mate y Salud, Montevideo, Uruguay.
dos Santos, K.C.G.; Lopez, D.S.H. ; Perez, L.M.; Roberti, L.; Schmid, P.; Figueiredo, I.; Peres, C.K.; C.A. Rojas. 2014. Análise da interação endofítica de microorganismos benéficos e a erva-mate. III Encontro de Iniciação Científica da Unila “Pesquisa no século XXI: desafios e possibilidades”, Foz do Iguaçu, Brazil.
2013
dos Santos, K.C.G.; Lopez, D.S.H. ; Perez, L.M.; Roberti, L.; Schmid, P.; Figueiredo, I.; Peres, C.K.; Rojas, C.A. 2013. Evaluación de la respuesta de la yerba mate a la inoculación con microorganismos potencialmente benéficos. IV Congreso de Agrobiotecnología, Propiedad Intelectual y Políticas Públicas, Posadas, Argentina.
dos Santos, K.C.G.; Lopez, D.S.H. ; Perez, L.M.; Roberti, L.; Schmid, P.; Figueiredo, I.; Peres, C.K.; Rojas, C.A. 2013. Avaliação da Resposta da Erva-mate à Inoculação com Microorganismos Potencialmente Benéficos. II Encontro de Iniciação Científica da Unila “Resultados em debate”, Foz do Iguaçu, Brazil.